la llegada de los españoles a America hacia el año 1500, se genero un cambio abrupto a la organisacion que habia en el territorio de esa epoca, devido a que en la expancion española, se fueron creando varios hacentamientos de manera abitraria deacuerdo a los intereses de cada grupo invasor.
 por otro lado, tenemos que tener en cuenta, el hecho de que los españoles generaron un desequilibrio cultural y racial al traer, poblaciones negras, de otras partes del mundo para la esclavitud, lo cual genero un aumento de la ignorancia, la desadaptacion, y probablemente la violencia.

En esta epoca, el Invasor Gonzalo Jimenez de Quesada  derroto a la cultura Chibcha  en el centro del pais, y fundo el nuevo reino de granada, la actual Bogotà, en la que establecio una nueva forma de govierno al crear la Real Audiencia  que pertenecía administrativamente al Virreinato del Perú, devido a que colombia no se concideraba colonia por la corona española, si no como una parte del reino ya que a la corona pertenecian todas las tierras descubiertas, deacuerdo a las caputulaciones del reino de castilla.

Para estos tiempos  se creo la encomienda, que hacia parte de las nuevas leye de Burgos, y que buscaba, integrar a los indigenas, a la cultura europea y evitar la extincion de la poblacion,  esta tambien se presento como centro de culturización y de evangelización obligatoria. Los indígenas eran reagrupados por los encomenderos en pueblos llamados "Doctrinas", donde debían trabajar y recibir la enseñanza de la doctrina cristiana a cargo generalmente de religiosos pertenecientes a las Órdenes regulares. Los indígenas debían encargarse también de la manutención de los religiosos; en esta, el encomendero, era un español, el cual devia ver por la salud y binestar ficico y espiritual  del  indigena o los indigeneas a su cargo, mas los  españoles radicados aqui no acataron las ordenes y se abolio esa ley, entranado a un nuevo proceso de dolor y maltratos para los indigenas colombianos, llamado MITA.